發表文章

目前顯示的是 5月, 2022的文章

【微學堂】Z因子解體真書:一次搞懂原理與應用!!

圖片
Z 因子(Z-factor)的由來 『HTS技術』(High Throughput Screening, 高通量篩選)是80年代後期發展起來的一種藥物篩選新技術,能夠準確、快速地從大型化學物庫中鑒定活性化合物(“Hits”),逐漸成為 新藥開發 中重要工具。 檢測中的所有數值都有一定程度的變化範圍,這是由於每種檢測方法的性質、儀器和人為的隨機誤差引起的擾動所造成。客觀上 測量變化越小,所選出的 Hits的“真實”可信度就越高 。 有兩種指標能用來約略表示檢測的品質: 1:訊號與雜訊的比值(S/N ratio) 2:訊號與背景的比值(S/B ratio)。 S/B的運算式定義為: S/B= mean signal mean background S/B值提供訊號與背景的比值,但無法顯示訊號和背景的變動差異 S/N 的運算式定義為: S/N= mean signal-mean background SD of background 相較於S/B,S/N值有針對背景值的變化作考量,因此在相同平均訊號與背景差異下,背景變動越小則S/N值越高。但S/N值並無考量到訊號的變動。 可是,這兩個指標都無法充分考量 樣品和背景測量的變異性 以及 訊號的動態範圍 ,因此都不能很好的反映檢測品質。 直到 1999 年,Zhang 等人定義了一個 “Z因子” (Z-factor) 作為評量標準,此係數可有效克服上述弱點,更適用於評估 試驗品質 。 Z因子它還有以下特點: 1:是 無因次量 (Dimensionless Quantity)的參數,因此適用於不同檢測分析的比較。 2:不僅為比較和評估分析的品質提供了有用的工具,還可 用於分析的優化和驗證 。 【 Z 因子的方程式 】 通常在驗證HTS 分析時,會將未知樣品與對照組一起進行分析。驗證測試中包含 陽性對照組 與 陰性對照組 的多個樣品測試,評估在活性範圍的兩個極端情況下,實驗再現性和訊號變化。其中陽性對照組平均值與陰性對照組平均值之間的差異就是檢測的 動態範圍 。 Z因子的方程式定義為: Z=1- 3(SD of sample+SD of control) |mean of sample-mean of control| Z 因子對資料可變性以及訊號動態範圍都可感應。例如當分子接近零(代表樣品與背景值的標準差極小),或者當分母接近無

疫苗我打了,然後呢...

圖片
發表:Molecular Devices (HK) 【 前言 】 最近台灣疫情升溫, 診所又出現了施打疫苗的熱潮,但是疫苗到底是怎麼起作用的呢? 為什麼注射疫苗之後還需要帶口罩和注意防護呢? 國家又為什麼要號召全民接種呢? 所有的問題,全都跟一個它有關—— 抗體 (Antibody) 。 我們接種疫苗的過程,可以理解為就是為這些 “識別系統” 發送“通緝令”的過程,只有足夠多的人群收到了這份“通緝令”,病毒的傳播才可能被阻斷。 但病毒也不是一成不變的,尤其像新冠病毒這種 RNA 病毒,單鏈RNA具有不穩定性,複製錯誤時不像 DNA 一樣有另一條鏈作為修復的範本,所以容易產生變異。 病毒一旦變異,對於體內的抗體來說,就像是易了容,有些易容沒有遮蓋到他們的特徵(特異性識別部位),拿到過通緝令的抗體仍舊可以將它們識別出來,但如果特異性識別部位發生了改變,抗體就沒辦法認出他們了。如果不小心感染了這類變異株,就仍然有感染發病的可能性。     抗體為整個免疫過程中的“識別系統”,而這個“識別系統”本身的“靈敏度”和“追蹤能力”就很重要了,這就是『 抗體親和力(Affinity)』 。 抗體親和力指的是抗體和抗原決定簇之間的結合力,其大小是評價抗體效果非常重要的指標。測量抗體對特定抗原的親和力,對於篩選抗體十分重要。 在生物藥物研發中,抗體親和力測量意義重大,如 單株抗體 ,測量抗體親和力,可以為適應不同用途選擇單株抗體提供依據,另外測量抗體親和力在早期挑選Hybridoma單株抗體,可以達到節省實驗成本、縮短實驗週期的目的。 親和力 是又稱 『解離平衡常數 Kd』 (單位 mol/L和濃度單位一致),是表示可逆反應過程中 反應物 (ex抗原、抗體)和 最終產物 (ex抗原-抗體複合物)之間的相對狀態的特徵參數。 親和力的強弱決定了最終決定反應完成時可逆反應 各組分相對多少 。 我們可以通過幾個化學反應案例來做說明。 範例 1: 氫氣和氫氣和氧氣在點燃的條件下生成水 氫氣 H 2 氧氣 O 2 反應終止後的體系內物質 莫耳濃度 2 1 H 2 O 莫耳濃度 >2 1 H 2 O 和 H 2 莫耳濃度 <2 1 H 2 O 和 O 2 化學反應進行到底的結果是某一類反應物反應完全,有此類反應的過程和結果特性的反應稱之為不可逆反應。 範例2: PD1 抗原(CD279