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【應用專輯】不能錯過!快速驗證 CRISPR 編輯細胞的好方法

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  【簡介】 2020年10 月 7 日諾貝爾化學獎揭曉,由法國生物化學家艾瑪紐埃爾·沙爾龐捷(Emmanuelle Charpentier)和美國化學家珍妮佛·杜德納(Jennifer A. Doudna)共同獲得,用以表彰兩位女科學家發現了基因工程上開創性的成就。她們共同開發出的CRISPR/Cas9基因剪刀,是目前最犀利的基因編輯工具之一。研究人員可以使用CRISPR/Cas9精準地改變動物、植物和微生物的基因片段,此一工具已徹底改變了生命科學領域,可廣泛地使用在植物育種、遺傳疾病治療、癌症治療等不同領域。 藉此機會,我們來聊一聊CRISPR/Cas9基因剪刀,並推薦一種檢驗方法,瞭解CRISPR/Cas9進行的細胞編輯是否能如你所願。   什麼是CRISPR/Cas CRISPR是『常間回文重複序列叢集(clustered regularly interspaced short palindromic repeats)』的縮寫,Cas是CRISPR相關蛋白家族的簡稱,兩者共同組成了一套系統,目前推測是細菌/古細菌中用來抵抗病毒和外源質體的天然防禦系統。當外源基因入侵時,該防禦系統的CRISPR序列會轉錄生成能與入侵基因組序列相識別的RNA,引導CRISPR相關酶(Cas)在序列識別位點切割外源基因組DNA,從而達到防禦目的。 根據Cas蛋白的特點,CRISPR/Cas基因剪刀分為三種類型,其中Ⅱ類最為簡單,僅藉助Cas9蛋白和gRNA(guide RNA )即可完成目標核酸的識別和剪切,準確性較高,操作容易,所以CRISPR/Cas9自從被發現以來,迅速成為了一種非常流行的基因編輯工具。 【前言】 CRISPR/Cas9發揮作用主要有三個步驟:  外源DNA序列插入到CRISPR序列的間隔區 形成 tracrRNA/crRNA複合物: CRISPR轉錄生成與外源基因匹配序列的前體crRNA(CRISPR-derived RNA),該crRNA再通過鹼基配對與tracrRNA(trans-activating RNA)結合成複合物。 此複合物引導核酸酶Cas9蛋白在與crRNA配對的序列靶位點進行雙股DNA剪切。   研究者可以設計改造crRNA和tracrRNA成為具引導作用的 gRNA